Kupada, Spor Toto Süper Lig'in 34 haftalık Lig Grubunu 9-18 sıralarında bitiren takımlardan kupada oynamak isteyen 8 tanesi yer alacak. Karşılaşmalar 4'er takımdan oluşan 2 grupta çift devreli lig usulüne göre oynanacak. Maçlar Lig TV'den canlı olarak yayınlanacak. A Grubu'nda MKE Ankaragücü, KDÇ Karabükspor, Orduspor ve Samsunspor yer alırken, B Grubunda da Gençlerbirliği, Gaziantepspor, Kayserisporve Medical Park Antalyaspor yer alacak. Maçlar sonunda gruplarını birinci sırada bitiren takımlar, TFF tarafından belirlenecek olan tarafsız sahada Final müsabakası oynayacak ve kazanan takım Spor Toto Kupası Şampiyonu olacak. Final maçında; seyirci hasılatı, gider ve hisseler kesildikten sonra, kalan net hasılatın yüzde 60'ını galip takım, yüzde 40'ını da mağlup takım kazanacak. Spor Toto Kupası'nın Finalinin yeri ve zamanı daha sonra paylaşılacak. Müsabakalarda tüm TFF Talimatları ve Spor Toto Süper Lig Statüsü ile Uluslararası Oyun Kuralları uygulanacak. Spor Toto Kupası 1. Hafta programı şöyle: 14.04.2012 Cumartesi 15.00 KDÇ KARABÜKSPOR-MKE ANKARAGÜCÜ (NECMETTİN ŞEYHOĞLU) 15.04.2012 Pazar 13.00 SAMSUNSPOR-ORDUSPOR (19 MAYIS)
13.00 GAZİANTEPSPOR-GENÇLERBİRLİĞİ (KAMİL OCAK) 16.04.2012 Pazartesi 19.00 MP ANTALYASPOR-KAYSERİSPOR (MARDAN)