Deplasmanda Bursaspor’a 3-2 mağlup olarak ateş hattından bir türlü uzaklaşamayan Trabzonspor, Spor Toto Süper Lig'in ikinci yarısında en az puan toplayan takımları arasında yer aldı. Ligin ikinci yarısının lideri ise bordo-mavili kulübün şampiyonluk polemiği yaşadığı ezeli rakibi Fenerbahçe oldu. 19 puan toplayan sarı-lacivertli kulübü 17 puan ile Galatasaray, Kasımpaşa ve Kayserispor takip etti. Karadeniz ekibi ligin ikinci yarısına teknik direktör Şenol Güneş ile başlarken bordo-mavili kulüp Güneş ile çıktığı Karabükspor ve Elazığspor maçlarında mağlup oldu. Bu maçlar sonrası Güneş istifasını yönetime sunarken, teknik direktör Tolunay Kafkas’ın görev yaptığı 7 lig maçında 2 galibiyet, 4 mağlubiyet ve 1 beraberlik aldı. Trabzonspor'u 24 puan ile 11 sırada alan Kafkas, söz konusu puanın üzerine 7 puan koyarak takımı 31 puana ulaştırdı ve küme hattı ile ardasında 2 puan bıraktı Bordo-mavili kulüp, ligin en az puan toplayan takımları arasında yer alarak camiasını bir ilk daha yaşattı. Ligin ikinci yarılarında yakaladığı çıkışlarla ön plana gelen Karadeniz ekibi, bu sezon bunu yapamadı. Ligin ikinci yarısında 6 puan toplayan Mersin İdmanyurdu ve Kardemir D.Ç. Karabükspor ligin en az puan toplayan takımları oldu. Bu iki takımı 7 puan ile Trabzonspor ve Medical Park Antalyaspor takip etti. Spor Toto Süper Ligi'n ikinci yarısında diğer takımların elde ettiği puanlar ise şöyle: "Bursaspor ve Gençelribriği 16 puan, Elazığspor 15 puan, Beşiktaş 13 puan, Eskişehirspor ve Gaziantepspor 12 puan, İstanbul Büyükşehir Belediyespor ve Akhisar Belediyespor 11 puan, Sivasspor 10 ve Orduspor 9 puan topladı."